B
分析：此題考查的知識點是不遺傳變異，解答時可以從引起變異的原因方面來切入．
解答：變異是指子代與親代之間的差異，子代個體之間的差異的現(xiàn)象．按照變異的原因可以分為可遺傳的變異和不遺傳的變異．可遺傳的變異是由遺傳物質改變引起的，可以遺傳給后代；由環(huán)境改變引起的變異，是不遺傳的變異，不能遺傳給后代．某菜農種了20株純種（基因組合是aa）的甜味菜椒，其中一個結了一個辣味菜椒，原因是該菜椒子房壁的遺傳物質發(fā)生了改變．辣味菜椒的辣味物質存在于果皮的液泡內．綠色開花植物傳粉受精完成后，子房發(fā)育為果實，子房壁發(fā)育為果皮，胚珠反應器種子，珠被發(fā)育為種皮．受精卵發(fā)育為胚．
A、附近辣味菜椒的花粉落到了該菜椒花的柱頭上，只是受精卵中的遺傳物質發(fā)生了變化，改變了胚的遺傳物質，而子房壁的遺傳物質沒有發(fā)生變化，與辣味菜椒的形成有無關系，故不符合題意；
B、某菜農種了20株純種（基因組合是aa）的甜味菜椒，其中一個結了一個辣味菜椒，原因是該菜椒子房壁的遺傳物質發(fā)生了改變．與辣味菜椒的形成有關．故符合題意；
C、菜椒子房中受精卵中的遺傳物質發(fā)生了變化，只是改變了胚的遺傳物質，而子房壁的遺傳物質沒有發(fā)生變化，與辣味菜椒的形成有無關系，故不符合題意；
D、菜椒中子房中珠被的遺傳物質沒有發(fā)生了變化，只是改變了種皮的遺傳物質，而子房壁的遺傳物質沒有發(fā)生變化，與辣味菜椒的形成有無關系，故不符合題意．
故選B
點評：解答此類題目的關鍵是理解引起變異的原因．可遺傳的變異是由遺傳物質改變引起的，由環(huán)境改變引起的變異，是不遺傳的變異，
